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春天，诚凛高中篮球社正迎接新进社员。主将日向和教练里子最关注的，是从美国回来的大个子火神大我，以及毕业于国中篮球界王者帝光国中的黑子哲也。在小比赛里，火神马上展现出压倒性的存在感以及天赋的才能。另一方面，黑子的存在感则薄弱到没有人注意到他的存在。但是黑子其实擅长利用自己的低存在感，使用“misdirection” 的手法，传出看不见的传球，原来他就是帝光国中“奇迹世代”的“幻之第六人”！
黑子与火神认同了彼此的实力。虽然黑子说要成为火神的影子，让诚凛成为日本第一，但是相对于“奇迹世代”各自进入篮球名校，黑子会选择去年才成立的诚凛高中，有他自己的原因。同时间，诚凛确定要与“奇迹世代”成员黄濑凉太就读的海常高中进行练习比赛。诚凛队员正鼓起士气时，黄濑本人以找黑子打招呼的名义出现了。等不及比赛的火神找上黄濑一对一斗牛，但是黄濑的实力令每个人都深感惊讶。黄濑邀请黑子加入他们，但是黑子拒绝了。
诚凛与海常的练习赛开打了。海常教练夸口练习赛只是用来当做先发球员的轻微调整，又保留王牌黄濑不上场，惹得诚凛全队爆怒，火神还把篮框灌爆了。看过一次就能完美再现球技的天才黄濑上场后，马上模仿了火神的灌篮，火神也随即回敬一球，因此比赛从一开始就像是没有防备的互殴一般，成了一场得分大战。在暂停时间里，黑子和黄濑都对自己的队友提出了对方的弱点。再上场时，诚凛加强了防守，但是比分还是越拉越大。比赛暂停时黄濑对火神说他不可能赢他们，没想到火神不仅激发了自己的斗志，还看出黄濑的弱点就是黑子。
进入第 2 节，诚凛逐渐拉近比数。黑子与火神联手进攻，让球队的攻击模式增加，而且即使天才黄濑具有极高的身体能力，存在感低到极限的黑子也是他唯一无法模仿的对象。黑子在意外状况下退场，但是队长日向以及 2 年级队员仍全力应战。之後黑子回到场上，终于将比数追平！这时候，黄濑的眼神明显改变……他真正的实力终于爆发！最后十几秒钟，诚凛加强进攻，黑子使出绝招，在抢到球后，抛向空中，佯装射篮，实际上是让火神进行空中接球，火神接到球后，扣篮，此时黄濑才反应过来，想去拦截，但是哨响球进。
诚凛与海常的练习赛，因为火神戏剧性地灌进致胜压哨球，最后由诚凛获得胜利。远离欢庆胜利的诚凛队员，在悔恨落泪的黄濑眼前出现的是“奇迹的世代”的 No.1 射手，现在就读秀德高中的绿间真太郎。因为秀德会在地区大赛中对上诚凛，所以绿间前来侦查。但是他对于比赛中的灌篮竞争，以及黑子进入无名新学校的选择，都显露出单方面的厌恶，并在发下不可能输给诚凛的豪语後离去。与绿间告别后，黄濑决定去找黑子。黑子表达了他对帝光打篮球的看法，以及对火神的看法，并认为火神有可能战胜“奇迹的世代”。黄濑承认火神虽然很厉害，但是离“奇迹的世代”其他四人还是有一定的距离。与此同时火神他们也发现了黑子不在，大家都去找黑子，最终火神在露天篮球场找到了黑子。有两对因为篮球场地的问题而发生了争执，其中一方利用人多耍赖。黑子他们决定出手，并秒杀了他们。最后黑子他们和大部队会合。
全国大赛预赛近在眼前。在同地区最大的敌人，是去年打进全国前八强，今年网罗到“奇迹的世代”绿间的秀德。为了在淘汰赛决赛中击败秀德，晋级决胜联赛，诚凛进行了远超乎以往的猛烈练习。尤其是去年以新学校队伍来说打出优异成绩，却在最後一步错失全国大赛出场资格的日向等 2 年级生，更是鼓足了干劲。士气高昂的迎接第一战。对手是在身高 2 公尺的塞内加尔留学生 - 帕帕加入后，一口气跃升为强队的新协学园。
被新协的 2 公尺长人选手帕帕当成小孩的黑子连续抄截，让球队在第一节就成功将比数大幅拉开。接下来的第二节是火神与帕帕直接对决。虽然帕帕斗志高昂，但是火神以更胜一筹的气势压制住他，诚凛漂亮的打赢第一战。另一方面，“奇迹的世代”成员绿间所属的秀德从首战就使出全力。绿间那百发百中、只要姿势不走样就绝对会命中的射篮大爆发，显现出绝佳状态。
全国大赛预赛开始，诚凛一路打进准决赛。对手是与网罗到绿间的秀德齐名，也被称为东京王者的强者——正邦高中。对日向和其他 2 年级队员来说，是去年惨败的对手。2 年级学长为了超越过去，下定决心求胜的姿态，让黑子与火神重新认知到想打赢比赛。可是开赛后，面对正邦融合古武术动作的压倒性防守能力，诚凛一直无法得分
全国大赛预赛的准决赛，秀德保留绿间战力，以游刃有余的态度确定晋级决赛。另一方面，挑战王者正邦的诚凛，靠著火神的灌篮与黑子的传球，让第一节以同分收场。可是与正邦黏人防守奋斗的火神，在第二节就被设计拿到第四次犯规。诚凛看来面临了最大危机，但是队长日向一脸冷静，说要把火神还有黑子换下场。诚凛 2 年级队员的眼中充满了决心。因为他们为了一雪前耻而研究了很久对付正邦的办法，并进行了刻苦的训练。
准决赛，王者正邦与诚凛之战进入最后关键时，黑子再度回到场上。2 年级学长的气魄，加上黑子与火神这些学弟对学长的敬意，让全队团结一心，严重威胁正邦。不过正邦也展现王者尊严，一步也不退让。白热化的比赛最后出现戏剧性结尾，由诚凛获胜。短暂休息后，与绿间就读的秀德展开决赛。开赛後双方互不相让，进入均衡状态。
虽然诚凛先被拿下分数，但是马上由接下黑子那回转式超长距离传球的火神还以颜色。诚凛靠著这招，间接封锁了绿间的超高导弹三分球。接著秀德换成高尾防守黑子，而且高尾成功阻止了黑子与火神过去无往不利的合作进攻。其实高尾拥有视野比诚凛的伊月更广、可以综观整个球场的鹰眼，是黑子的 misdirection 无法发挥效果的对手！
不只是从中场，甚至从己方篮框附近都能投球得分的绿间，气势锐不可当。第2节结束，诚凛被拉开将近20分。黑子的misdirection被高尾封锁，只能在场边观战。日向等人拼命保持专注，努力追赶秀德，却一直找不到突破口。这时候，火神想到黑子即使坐板凳也不放弃的精神，决定就算不靠黑子或学长帮忙也要获胜，发挥出天赋的才能，展现压倒性的存在感！
决赛终于进入第4节。做好准备再度上场的黑子，继续受到高尾严防。可是黑子已经有了应对策略。另一方面，火神的体力也快到极限了，最多只能再跳2次。精疲力竭的状态下，终於在还剩2分钟的时候追到跟秀德只差一分。是秀德会拉开比数，还是诚凛会追过，划分命运的暂停…秀德决定将之后的进攻全交给绿间。诚凛也决定赌在队长日向的三分球上。
激战之後，诚凛打赢秀德，晋级全国大赛预赛的决胜联赛。一行人在回程时休息吃饭的店里，巧遇秀德的绿间与海常的黄濑等人，还突然决定收留黑子捡来的小狗「哲也2号」。大家为了准备决胜联赛不断特训，这天在泳池练习时，决胜联赛的对手桐皇学园的经理、自称是黑子女朋友的桃井跑来找黑子，同时间，桐皇的“奇迹的世代”王牌青峰大辉，出现在进行个别训练的火神面前！
即使决胜联赛即将开打，桐皇学园的王牌青峰还是我行我素的翘掉练习。面对反弹的队员，主将今吉以青峰强到像犯规的实力，以及桐皇不倚赖团队合作的原则劝退他们。另一方面，与青峰一对一斗牛惨败的火神，从黑子口中听说青峰过去曾比谁都喜爱打篮球，之後却改变的事情，再度立誓要打赢比赛。接著到了比赛当天桐皇的休息区竟然不见青峰的身影。
在青峰尚未抵达的情况下，桐皇与诚凛的比赛开始了。即使青峰不在，桐皇仍以主将今吉为中心，靠队员的个人技巧展现出全国水准的坚强实力，而诚凛也以团体进攻对抗。可是桐皇的经理桃井凭藉压倒性的情报收集能力，以及根据现状推断成长性的分析力，甚至将诚凛首度运用的合作进攻都挡下了。桃井打算封锁诚凛的攻势…但是她唯一无法预测的就是黑子的行动！
第2节剩下30秒，诚凛还落後10分的时候，青峰来了。青峰打算一边热身一边轻松取分，马上展现出高超球技，但是黑子&火神也立即应战、毫不退让，引起会场观众惊叹。面对比想像中更有战力的诚凛搭档，青峰开始有了干劲，打算在下半场认真打。另一方面，诚凛让misdirectio效果减弱的黑子下场休息，决定赌一把让火神去压制青峰。接著下半场开始，青峰终於彻底认线集 我绝对不要！
青峰无视一般理论的街头篮球打法，让诚凛束手无策。虽然火神拼命追赶，还是被青峰轻易超越，慢慢把比数拉开。再被拉开比数就无法翻身的诚凛决定派黑子上场，靠传球攻势拉近比数。但是，国中时最常接黑子传球的青峰，看得到黑子的传球。青峰展现自己抄球又连过五人的超强本领技压诚凛後，对黑子说：“你的篮球是赢不了的”。
诚凛以压倒性的比数败给桐皇。虽然大家在接下来的两战使出全力，但是被青峰彻底击败的黑子陷入低潮，加上脚伤恶化的火神无法上场，最后吞下连败…诚凛在高中联赛的挑战结束了。可是那也是以冬季选拔赛为目标的新挑战的开始。只是青峰造成的影响让黑子与火神产生歧异。现在这样是赢不了的… 在两人各自烦恼时，诚凛高中篮球队的创立者兼王牌木吉，出院归队了！
归队的木吉，一出现就要求和火神一对一较量，还只派黑子、火神及一年级队员和较弱的对手进行练习赛，就像是有什麼企图。木吉的目的，是让败给青峰之後开始单打独斗的火神注意到团队合作的重要性…本以为是这样，结果他完全不担心火神，真正的目的是让黑子发现目前篮球风格的极限。这时候，黑子告诉日向，希望退出首发名单。
为了让自己变得比现在更强，结合更大的力量打倒“奇迹的世代”…黑子与火神有著共识，以冬季选拔赛为目标的新挑战开始了。里子那被视为夏季集训最大难关的绝望级厨艺，也在火神的指导下勉强改善後，海边的夏季集训开始了。为了提升每个人的动作精准度，诚凛要达成比平常多三倍的练习。而第二天早上，竟然在民宿遇到绿间和秀德高中的人。原来他们也是住在同一间民宿！
地狱般的夏季集训，诚凛与秀德进行了共同练习。为了对抗“奇迹的世代”，独自做特别练习的火神打算加强空中战的能力，却在与绿间的一对一比试中彻底败北。但是这也让火神发现输的原因以及今後的目标。看到这样的火神，黑子也努力找出自己的新风格。结束集训的诚凛，决定直接去看全国大赛。对战学校是海常VS桐皇，“奇迹的世代”的冲突，黄濑VS青峰的决战开始了！
海常VS桐皇的比赛，由“奇迹的世代”成员黄濑与青峰的对决揭开序幕。青峰压制黄濑的进攻，让桐皇抢得先机，而海常也以队长笠松为中心展开反击，一来一往互不相让。处於劣势的黄濑，在多次交手之後终於成功阻挡青峰，第一节就在海常领先的状态结束。可是进入第二节后，开始发挥实力的青峰，彻底压制黄濑，把比数渐渐拉开！
即使是只要看过一次就能完美模仿球技的天才黄濑，也无法模仿青峰独一无二的打法。可是，为了战胜青峰，黄濑还有海常选择挑战模仿青峰。虽然比数追到了9分的差距，但是还要一些时间才能完全模仿。接著迎来的第三节，黄濑比桃井预测的还要更快逼近青峰，但是青峰也毫不退让。背负著初次感觉到的团队情谊与信赖，天才黄濑终于觉醒了！
全国大赛半准决赛，海常VS桐皇之战终於进入第4节，青峰与黄濑的对决，在双方都毫不退让的状态下来到终场前一分钟。由黄濑进攻，青峰防守。接著决定胜负的瞬间终於到来…！亲眼见识到“奇迹的世代”之间的高水准竞争，诚凛的队员还有秀德的绿间、高尾等人，都开始思考要如何迎接冬季选拔赛。而黑子与火神又再度下定决心，立誓要合力打倒奇迹世代。
为了在冬季杯上能全面对抗“奇迹世代”，诚凛高中篮球部进行了高度的强化训练。某日，参加练习球赛的黑子一行，在会场遇见了火神在美国结识的兄长：冰室辰也。过去一起学习打篮球、相互竞技篮球技巧，在没有分出胜负的状态下就分开的两人，面对这样的兄长，火神的态度却很模棱两可。为何火神会如此态度…？另一方面，和冰室同属阳泉高中篮球部的“奇迹世代”紫原敦也出现在了会场。
天公不作美，一年级的诚凛队员和由紫原、冰室组成的临时队伍刚开战，就大雨瓢泼，无奈街头篮球比赛只能作罢，而下次见面就是在冬季杯赛上了，这时，丽子打来电话让他们尽快返回训练场，路上，火神从黑子口中大概了解了紫原这个人。黑子刚到训练场，桃井就哭着扑了个满怀，原来她和青峰发生了矛盾，在送桃井回家的路上，黑子向她展示了新技法，这让桃井感到莫大的威胁。
终于迎来了冬季杯预选赛，一切准备就绪，剩下的只有全力以赴。诚凛高中的首场开战对手是全国大赛预选赛前八强的丞成高中，比赛伊始，丞成高中就对火神采取双人夹击，让火神难以大展身手，当他们以为诚凛高中内线薄弱，主攻内线时，中锋木吉的表现让所有人出乎意料，因为对手根本无法预测他的打法，最终，这场比赛以火神的高空灌篮为结尾，胜利告终！
预选赛转瞬即逝，秀德、泉真馆、诚凛和雾崎第一高中打入决胜循环赛，诚凛在决胜循环赛的第一个对手是泉真馆，比赛中，诚凛展现出不同于以往的实力，赢得比赛。而另一边，秀德也轻松获胜，然而能够出场冬季杯决赛的只有一支队伍，是诚凛还是秀德？这两支短暂休息的队伍，刚上场就火力全开进入了状态，火神连续拦下绿间的投球，然而绿间的目的却只有一个那就是，不断的投篮直到将火神体力耗尽无法进行高弹跳。
比赛依旧激烈进行，诚凛虽在开场时领先于秀德，但火神为了防守绿间已经消耗了不少体力，而黑子也被高尾紧盯难以施展变幻莫测的传球，更让人意外的是以往孤军奋战的绿间居然在这场比赛中配合其他队友。之后，诚凛换下黑子并计划死封绿间疯狂夺分，可秀德也开始加速夺分，缩小与诚凛的差距，随后前半场比赛在绿间的一个超长距离三分球中结束。在后半场的比赛中，诚凛完全处于被动状态，为扭转局势，黑子带着他的新球技重返赛场。
黑子一上场就用“消失的运球”为诚凛连夺八分扭转局势，这无疑惊呆了全场人，秀德也突然没了对策。在最后十分钟的比赛中，诚凛采用变幻莫测的跑轰战术连连夺分，秀德自然不甘落后，两队的比分你追我赶不分伯仲，比赛还剩最后两秒的时候，绿间拦下了木吉的灌篮，然而却因为推人犯规被罚两球，对于暂时落后秀德一分的诚凛来说，这两球尤为重要，木吉顶着巨大的压力成功投入一球将比分持平，然而这最后的命运一球能否顺利投入篮筐？
没想到比赛最终以诚凛和秀德打成平手而告终，火神与绿间相约冬季杯赛上分胜负。木吉旧伤复发，虽然日向劝他放弃接下来与雾崎第一高中的对决，但他却一口否决，说这是今年最后的机会，自己一定要上场，无意听到他们对话的火神，在这之后向日向询问了此事，日向讲起了木吉创建诚凛篮球部的事情。
在木吉坚持不懈的诚恳邀请下，日向的内心渐渐有所动摇。当木吉在天台上当着全校学生的面大声宣誓诚凛高中篮球部成立的消息以及目标时，日向出现并宣布自己正式成为诚凛高中篮球部的一员。之后，艰苦的训练在丽子的督促下开始，在诚凛与雾崎第一高中的比赛中，木吉受伤，由于伤势严重，不能迅速恢复重返赛场，于是，日向与木吉约定在来年的比赛中一定打入全国大赛成为日本第一！
诚凛再遇老对手雾崎第一高中，这轮比赛注定是场硬仗！比赛伊始，诚凛队出手不凡，拿下了上场的第一分，然而，雾崎高中也并非等闲之辈，在接下来的比赛中，他们卑鄙的利用裁判的视觉死角，频频犯规故意伤人，为了保护队友，木吉发誓一定要打败宿敌花宫真，成为诚凛队的坚实后盾，绝对不允许队友遭到攻击！
木吉的舍身奋斗，使诚凛第二节後来居上，获得领先。看见愚弄木吉，对篮球展现不诚实态度的花宫，黑子心中的怒火悄悄点燃。一进入第三节，雾崎第一做好准备派濑户上场。在花宫与濑户的合作下，以「蜘蛛网」百分之百拦下伊月的传球，逆转了比数。拚命过头的日向，连一球都没投进，导致诚凛陷入窘境。於是在即将开始的第四节，为了突破蜘蛛网的封锁，黑子打算放弃打团体战！？
接受日向和里子等人的劝说，满身疮痍的木吉下场休息。两队持续进行激烈的攻防时，摆脱不了对花宫的怒气的日向，惊觉自己与木吉的约定并非「打倒花宫」，而是「成为日本第一」，最後终於找回原有的实力。日向手感发烫的三分球，让完全点燃士气的诚凛成功逆转。然而「恶童」花宫嘲笑这种努力奋战的卑劣打法，终於让黑子…！
确定参加冬季选拔赛後，诚凛篮球队一行人到温泉旅馆放松身体。没想到竟和在附近打练习赛的桐皇学园碰个正著。诚凛队员以为是碰巧，今吉等人却说是来打招呼的。原来刚公布的冬季选拔赛赛程表，诚凛的初赛对手竟是桐皇学园！面对不久後的再次对决，黑子、火神和青峰之间燃起战火。诚凛篮球队鼓起干劲，重新展开集训。他们在里子的父亲──景虎的带领下，将寻找各自独有的武器。然而不知为何，其中却不见火神的身影……
经过一个月的短暂集训，每个人的技能都有所提升，随之而来的便是万众瞩目的冬季杯！在开幕式结束后，黑子应赤司之邀与“奇迹的世代”赛前聚首，这时，从美国回来的火神出现，他的出言不逊惹怒了赤司，也正因如此而感受到了赤司强大的气场。比赛正式开始，诚凛的对手桐皇一上场就以一个空中接力抢夺了先机，然而，诚凛自然不会仍由他们掌握主动权，黑子使出了改良版加速传球……
黑子以加速传球突破青峰的防守，之后在木吉和火神的完美配合下投进一球，然而，诚凛却在接下来的比赛中陷入苦战，被丽子叫停短暂休息后，日向找回状态一上场就连续投入三分球，可对方的樱井也是遇强则强的球员二人你追我赶不分上下，在第一节结束之际，日向以一个压哨球追平比分。虽然得知了黑子运球的秘密，但青峰还是坚持以自己的方式进行反击，没想到第二节一开始，青峰就轻易拦下了黑子的传球……
火神并没有因为黑子被换下场而变得心神不宁，反而以一种放松的状态面对敌手，没有了对黑子的依赖，他解放了自己潜在的能力，连连突破青峰的防守，逐渐缩小与桐皇的差距，在上半场结束之际将比分缩小到两分之差。火神潜力的爆发让青峰很是兴奋，在后半场的比赛中，青峰火力全开，虽然返场的黑子看穿了他的动向，但桐皇方面也同时派出了今吉紧盯黑子。
今吉凭借桃井的预测以及自己对黑子意图的揣摩，破解了他的视线诱导，与此同时，青峰也因遇到劲敌火神而慢慢找回原来的状态，场上的情况对诚凛愈发不利，想要逆转绝非易事，可是即便如此也没有人轻言放弃大家反而斗志高涨，之后黑子使出了杀手锏视线诱导大超越，使得诚凛在第三场结束时缩小了与桐皇的差距，距比赛结束还有最后十分钟，诚凛能否赢在当下？
诚凛和桐皇的比赛进行到白热化的状态，诚凛秉承自己一贯的团队合作通过视线诱导大超越将桐皇逼至绝境，面对双方分数差距逐渐缩小，桐皇也开始反击，可是黑子竟然拜托火神和铁平三人一起封锁青峰的行动，面对这样的强力阵容，青峰是不会被阻止的，进入自己zone的青峰展现出了惊人的才能，诚凛还有希望赢得这场比赛吗？
青峰、火神俩人都进入了zone状态，集中力和反应速度均已经超越了最高级，这是王牌与王牌之间的对决。青峰受时间的局限，率先脱离了zone状态，火神趁机投进一球，两队之间仅有1分之差，青峰说现在才是最激烈的时候，真正的好戏才刚开始。重新进入zone状态的青峰迅速投入一球，将比分拉到了三分，在接下来的15秒中，诚凛会如何反击呢？
诚凛众人来到火神家进行庆祝，就在大家还对着对火神家感慨时，丽子的恐怖料理做好了，虽然这次恐怖水果料理意外美味，但是大家依旧还是出现了中毒现象。之后小金走错房间发现了一位裸睡的女子，而这个性感的美女竟然是火神的师傅亚历克斯。随后亚历克斯观看了秀德和大仁多的比赛，因为绿间的表现亚历克斯对火神开始了特训……
比赛开始了但诚凛篮球队的众人却因为之前的获胜而不在状况内，在黑子的建议下丽子申请了暂停。随后在顺平的激励分析下，丽子为了激励众人赏了每人一巴掌，而顶着手印上场的诚凛众人却斗志十足的一路获胜。之后诚凛对战阳泉的比赛也终于到来，虽然一开赛紫原就发生了犯规， 但是身为“奇迹时代”的紫原也带给了诚凛压迫感，最终诚凛众人能够战胜紫原带来的压迫感吗？
诚凛在与阳泉的比赛中陷入了困境，面对被阳泉狠狠压制的场面，诚凛却没有因此丧失斗志。在这样的不利情况下黑子主动要求上场，随后面对防守黑子成功灌篮，黑子的高超技术令紫原和阳泉众人十分震惊。同时一直因为对手身高被压制的火神，也在铁平的提点下，找到了对应的方法成功的摆脱了来于对手的身高压制。而火神与冰室的决战也终于到来了……
诚凛在与阳泉的比赛进入了白灼化，冰室高超的技术狠狠的压制住了火神，并震惊了全场。随后冰室因为自己想狠狠打败火神的愿望与火神彻底决裂。面对强势和无情的冰室，火神大受打击。随后诚凛申请暂停换下了火神，在木吉一个灌篮后，诚凛再度燃起斗志，慢慢拉回了比分。因为诚凛的出色表现激起了紫原的不甘，而冰室与火神又会有怎样的较量……
一向擅长防守的紫原现在开始了进攻，不光轻易弹开了三人的围防还硬生生的扯坏了篮架，怪物一般的紫原肆意的践踏着木吉想要保护同伴的承诺。分享者影视。在激励的冲突中木吉不幸受伤，代替木吉上场的黑子向紫原做出了战的宣言，篮球人生完全相反的两人将在此分出胜负，黑子将会与同伴们并肩作战来对抗否定努力的紫原。
打算和紫原一样拦下2分线内所有球的火神并没有那么顺利，一心想要进入Zone状态的他却忽视了发动的条件，在黄濑的提醒下火神终于调整好了心态。占着上风的阳泉清楚的感觉到了火神带来的压来，进入了Zone状态的火神已经没有人可以阻挡，而冰室的坚持让紫原打消了懈怠的情绪，在比赛最后的3分钟将爆发激烈的冲突。
